갑상선 유두 암 환자의 나이에 따른 예후와 관련된 유전체 발현 양상 분석: cBioPortal을 사용한 Pan-Cancer Atlas 분석

Abstract

배경: 나이는 갑상선 암의 생존에 있어 가장 중요한 예후 인자 중 하나로, 여러 갑상선 암 위험도 평가 체계에서 나이가 주요한 요소로 고려되어 왔다. 하지만 이에 영향을 주는 유전자에 대한 연구 결과는 부족한 실정이다. 연구방법: 본 연구는 cBioPortal를 이용하여 2018년도 새롭게 발표된 Pan-Cancer Atlas 데이터를 활용하여 20세 이상 갑상선 유두 암 환자(490명)의 임상 및 유전자 정보를 얻은 뒤, 55세 미만(325명)과 55세 이상(165명)의 두 군으로 환자들을 구분하였다. 두군 간에 유의하게 발현량이 차이가 나는 mRNA (812개)를 추출 하고 R을 활용하여 812개 모든 유전자들에 대하여 55세를 기준으로 무진행 생존(PFS)과 전체생존기간(OS)의 차이를 계산 하였고, 그 중 p value가 통계적으로 유의하게 차이가 나는 유전자만 추출 하였다. 이후, 각 유전자에 대하여 갑상선 분화도(thyroid differentiation score (TDS), BRAFV600E-RAS score (BRS), extracellular signal-regulated kinase 점수(ERK 점수))와 상관관계를 분석 하였다. 결과: 환자들의 평균 나이는 47.9세 였고 그 중 165명(33.7%)가 55세 이상이었다. BRAF 돌연변이는 254명(51.8%)에서, RAS 돌연변이는 48(9.8%)에서 발견되었다. 55세 이상 환자가 55세 미만 환자와 비교 시 통계적으로 유의하게 생존 위험도가 증가되어 있었다(hazard ratio = 35.1, p < 0.001). 총 14개의 유전자(ABCF1, ENTPD1, F12, FLAD1, GPATCH4, HCG11, IARS2, KBTBD2, NRSN2, PPP2R1B, QSOX2, RINL, RRP36, ZFAND5)가 55세 이상의 병의 재발 및 생존 위험도 증가와 관련된 유전자로 확인되었다. 각 유전자와 갑상선 분화도와 상관관계 분석을 하였다; TDS와 양의 상관관계를 보이는 유전자(F12, NRSN2, PPP2R1B, RRP36), 음의 상관관계를 보이는 유전자(KBTBD2), BRS와 양의 상관관계를 보이는 유전자(ABCF1, FLAD1, IARS2, RRP36), 음의 상관관계를 보이는 유전자(ENTPD1, HCG11, KBTBD2, QSOX2, RINL, ZFAND5), ERK 점수와 양의 상관관계를 보이는 유전자(ENTPD1, HCG11, IARS2, KBTBD2, RINL, ZFAND5), 음의 상관관계를 보이는 유전자(ABCF1, NRSN2). 결론: 본 연구에서는 cBioPortal를 이용하여 Pan-Cancer Atlas 데이터를 통해 유두 갑상선 암 환자에서 나이와 관련된 예후에 영향을 미치는 유전자를 확인하였다. 또한 이들과 갑상선 분화도 상관성을 입증하였다. 향후 해당 유전자들을 임상 치료 및 예후 평가에 적용할 수 있는 후속 연구가 필요하겠다.